Направление: 011200 Физика
Профиль: Молекулярная биофизика
Кафедра молекулярной биофизики
Научный руководитель: к. ф.-м. н., доцент Поляничко А.М.
Рецензент: к.б.н., Морозова А.В.

Посттрансляционные модификации линкерных белков хроматина .
Бабич Алёна Валерьевна

Поиск посттрансляционных модификаций линкерного гистона Н1 осуществлялся методом матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации. На первом этапе были выделены гистоны Н1 теленка и Н1 мыши. Затем производилась первичная очистка выделенных белков методом электрофореза по методу Леммли. Затем для анализа белков методом «отпечатков пальцев» производилась обработка образцов трипсином. Масс-спектры Н1 теленка, Н1 мыши были получены на масс-спектрометре Varian 902-MS MALDI со сверхпроводящим  магнитом 9.4 Тесла, оснащенном УФ лазером (Nd) в режиме положительных ионов. Спектры получали в диапазоне масс 500-3000 m/z, выбирая мощность лазера оптимальную для достижения наилучшего разрешения. Обработка спектров производилась в программах Mascot, MS-Fit и MS-Digest. 
По итогам работы можно сделать следующие выводы:
1.	Для линкерного гистона Н1 тимуса теленка характерны следующие посттрансляционные модификации:
1.	Ацетилирование по лизину гистонов Н1.2, Н1.3 в положении К17: Н1.2K17ac, H1.3K17ac
2.	Метилирование по лизину гистона Н1.5 в положении K76: H1.5K76me
3.	Формилирование по лизину гистонов Н1.3 и Н1.4 в положениях K157 и K155 соответственно: H1.3K157f, H1.4K155f
2.	Для гистона Н1 тимуса мыши характерны следующие модификации:
1.	Ацетилирование по лизину гистона Н1.2 в положении К17: Н1.2K17ac
2.	Метилирование по лизину гистона Н1.5 в положении K76: H1.5K76me
3.	Фосфорилирование по серину гистона Н1.2 в положении S173, T146, T154: H1.2S173p, H1.2S146p, H1.2S154p
4.	Фосфорилирование по серину гистона Н1.4 в положении S187: H1.4S187p

Список публикаций
1. Sitnikova A., Starkova T., Artamonova T., Karpenko V., Polyanichko A., Chikhirzhina E., Kostyleva E., Tomilin A. (2013). Application of mass spectrometry to the characterization of post-translational modifications of chromosomal proteins. FEBS Journal, 280 (Suppl. 1) P. 131.

2. Старкова Т.Ю., Бабич А.В., Костылева Е.И., Скворцова Е.В., Поляничко А.М., Чихиржина Е.В., Томилин А.Н. (2014) Исследование посттрансляционных модификаций ядерных белков хроматина Н1 и HMGB1/2 методами МАЛДИ- и электроспрей-масспектрометрии. Всероссийский симпозиум "Cтруктура и функции клеточного ядра", Санкт-Петербург, 28–30 октября 2014 г. Цитология, Т. 56, Вып. 9. С. 682.