Title: ПРАВИЛА ОФОРМЛЕНИЯ ТЕЗИСОВ КОНФЕРЕНЦИИ ВНКСФ-7
Author: Sergey Trapeznikov
Last saved by: Chizhik
Company: Saint-Petersburg State University

Специализация: 010700 Физика конденсированного состояния вещества
Программа: 03Магнитный резонанс. Физические аспекты и приложения
Руководитель программы: проф. В.И. Чижик
Кафедра квантовых магнитных явлений
Научный руководитель: доц. А.В. Егоров
Рецензент: доц. А.В. Комолкин

Структура сольватной оболочки иона никеля в смеси вода-глицерин по данным метода Молекулярной динамики реплик
Бенкевич Владимир Викторович

В работе рассматривалась система, состоящая из: 1 иона никеля, 340 молекул воды, 100 молекул глицерина. Моделирование проводилось с помощью метода Молекулярной динамики реплик (МДР) в кубической ячейке с периодическими граничными условиями. Длина ребра ячейки составляла 28.14 Å, что соответствует плотности раствора 1.11 г/см^3. Для моделирования системы методом Молекулярной динамики использовался пакет MDynaMix 5.0.
Большое внимание в работе уделялось выбору оптимальных параметров МДР и оценке его эффективности. Для этого перед запуском моделирования системы проводись предварительные расчеты, и частично автоматизированный, анализ полученных данных.
В качестве основных результатов можно отметить следующее:
1.	Разработан пакет программ, реализующий МДР.
2.	Отработана и частично автоматизирована методика подбора параметров МДР, обеспечивающих его высокую эффективность.
3.	Проведена оценка эффективности МДР. Для выбранной системы и параметров МДР рост производительности относительно Молекулярной динамики достиг 85 раз.
4.	Проведено моделирование системы никель-глицерин-вода методом МДР в течении 5 нс с использованием 64 реплик.
5.	По результатам моделирования получены различные типы строения первой сольватной оболочки иона никеля, и проведена оценка вероятности их появления при различных температурах. 

Список публикаций
1. В.В. Бенкевич. Пакет программ для моделирования молекулярных систем с большими временами обмена лигандов // Материалы 7-ой зимней молодёжной школы-конференции «Магнитный резонанс и его приложения», с.129. Санкт-Петербург, 2010.